L'Organizzazione interna di AER SpA prevede i seguenti settori:

1. Servizi Tecnici e Gestione degli Impianti;
2. Amministrazione, Finanza e Controllo;
3. Servizi generali; 
4. Sicurezza e qualità (QAS).

AER SpA da' lavoro a oltre 80 dipendenti. L' 85% sono occupati nei servizi e il restante 15% lavora negli uffici direzionali. Inoltre AER Spa, attraverso l’esternalizzazione di alcuni servizi, quali carta, ingombranti, manutenzione del verde e trasporto rifiuti, dà lavoro ad almeno altre 40 persone.

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